Çerez Örnek

Moleküler Biyoloji Laboratuvarı

Anabilim Dalımızda moleküler tıp kavramını; yansıtabilen, genom bilim alanınnda teknolojik yetkinlik kazanmış; bir rutin laboratuvarımız hizmet vermektedir. Anabilim Dalının rutin olarak vermiş; olduğu Moleküler Tanı hizmetleri aşağıda listelenmiştir. Moleküler Biyoloji laboratuvarı yeni yapılan bölümleri ile 2004 yılınndan bu yana bir çok Anabilim Dalına 40 adet rutin moleküler analiz yapmakta olup, halen Ege Üniversitesi Genetik Tanı Merkezi ile birlikte rutin moleküler analiz hizmeti vermektedir.

Anabilim Dalımızda vizyonumuz gen ve hücre düzeyinde özellikle yeni tanı ve tedavi yöntemlerine yönelik temel ve uygulamalı araştırmalar yapmak, hasta hizmetleri geliştirmektir. Anabilim dalımızda, toplumda yaygın olarak görülen trombolifi, hipertansiyon ve hiperlipidemi gibi hastalıklara yatkınlığın değerlendirilmesi amacıyla bu hastalık gruplarında mutasyon /polimorfizm analizi ve genotipleme yapılmaktadır. Yapılan testler aşağıdaki tabloda gösterilmektedir.

Ayrıca lösemi hastalıklarına moleküler tanı açısından yardımcı olmak amacıyla lösemi panelinde farklı translokasyon testleri ve lenfoma tanısı ve sınıflandırmasına yardımcı olmak amacıyla B-Hücre Immunglobulin gen klonalitesi ve T-hücre reseptörü gen klonalitesi testleri yapılmaktadır. Kanserde ilaç hedefine yönelik yeni nesil DNA dizileme (NGS) de yapılmaktadır.

 

Moleküler Biyoloji Laboratuvarında Yapılan Moleküler Analizler

 

Lösemi Paneli 

t(1;11)(p32;q23) MLL-EPS15

t(9;11)(p22;q23) MLL-MLLT3

t(12;21)(p13;q22) ETV6-RUNX1

t(1;11)(q21;q23) MLL-MLLT11

t(9;12)(q34;p13) ETV6-ABL1

t(12;22)(p13;q11-12) ETV6-MN1

t(1;19)(q23;p13) TCF3-PBX1

t(9;22)(q34;q11) BCR-ABL1 (m-bcr, p190)

t(15;17)(q24;q21) PML-RARA (bcr1, L)

t(3;21)(q26;q22) RUNX1-MECOM

t(9;22)(q34;q11) BCR-ABL1 (M-bcr, p210)

t(15;17)(q24;q21) PML-RARA (bcr2, V)

t(3;5)(q25.1;q35) NPM1-MLF1

t(9;22)(q34;q11) BCR-ABL1 (µ-bcr, p230)

t(15;17)(q24;q21) PML-RARA (bcr3, S)

t(4;11)(q21;q23) MLL-AFF1

t(9;9)(q34;q34) SET-NUP214

t(16;21)(p11;q22) FUS-ERG

t(5;12)(q33;p13) ETV6-PDGFRB

t(10;11)(p12;q23) MLL-MLLT10

inv(16)(p13;q22) CBFB-MYH11

t(5;17)(q35;q21) NPM1-RARA

t(11;17)(q23;q21) MLL-MLLT6

t(17;19)(q22;p13) TCF3-HLF

t(6;11)(q27;q23) MLL-MLLT4

t(11;17)(q23;q21) ZBTB16-RARA

t(X;11)(q13;q23) MLL-FOXO4

t(6;9)(p23;q34) DEK-NUP214

t(11;19)(q23;p13.1) MLL-ELL

 

 

NGS Kanser Paneli   

AKT1

ALK

BRAF

CTNNB1

DDR2

EGFR

ERBB2

ERBB3

ERBB4

ESR1

FBXW7

FGFR1

FGFR2

FGFR3

FLT3

GNA11

GNAQ

HRAS

KIT

KRAS

MAP2K1

MAP2K2

MET

NOTCH1

NRAS

PDGFRA

PIK3CA

RAF1

SMAD4

STK11

 

NGS Meme Kanseri Paneli   

BRCA1

BRCA2

PTEN

TP53

 

 

NGS Akciğer Kanseri Paneli 

AKT1

ALK

BRAF

DDR2

EGFR

ERBB2/HER2

ESR1

FGFR1

KIT

KRAS

MAP2K1

MET

NRAS

NTRK1

PDGFRA

PIK3CA

PTEN

RICTOR

ROS1

 

 

NGS Akciğer Kanseri Füzyon Paneli

AGTRAP-BRAF

AKAP9-BRAF

ATIC-ALK

CCDC6-RET

CD74-NRG1

CD74-NTRK1

CD74-ROS1

CEP89-BRAF

CLCN6-BRAF

CLTC-ALK

DCTN1-ALK

EML4-ALK

ERC1-RET

ERC1-ROS1

ESRP1-RAF1

EZR-ROS1

FAM131B-BRAF

FCHSD1-BRAF

FGFR1-PLAG1

FGFR1-TACC1

FGFR1-ZNF703

FGFR3-TACC3

FN1-ALK

GATM-BRAF

GNAI1-BRAF

GOLGA5-RET

GOPC-ROS1

HACL1-RAF1

HERPUD1-BRAF

HIP1-ALK

HOOK3-RET

KIF5B-ALK

KIF5B-RET

KLC1-ALK

LMNA-NTRK1

LRIG3-ROS1

LSM14A-BRAF

MET exon 14 skipping

MKRN1-BRAF

MYO5A-ROS1

NCOA4-RET

NPM1-ALK

NTRK1-TPM3

PCM1-RET

PPFIBP1-ALK

PPFIBP1-ROS1

PRKAR1A-RET

PWWP2A-ROS1

RAF1-DAZL

RANBP2-ALK

RNF130-BRAF

SDC4-ROS1

SEC31A-ALK

SLC34A2-ROS1

SLC45A3-BRAF

SQSTM1-ALK

STRN-ALK

TFG-ALK

TFG-NTRK1

TPM3-ALK

TPM3-NTRK1

TPM3-ROS1

TPM4-ALK

TRIM24-RET

TRIM33-RET

UBE2L3-KRAS

VCL-ALK

ZSCAN30-BRAF


			

 


 

Hücre kültürü Laboratuvarı

Hücre kültürü Laboratuvarı Bu laboratuvarımızda, fibroblast kültürü, beyin tümörü hücre kültürleri ile çeşitli hücre serilerinin kültürleri yapılabilmektedir.

 

 


Ege Üniversitesi

EGE ÜNİVERSİTESİ